Subdiviziuni
Direcţia prevenirea şi controlul bolilor netransmisibile
Direcţia prevenirea şi controlul bolilor transmisibile
Direcţia management al urgenţelor de sănătate publică
Direcţia diagnostic de laborator în sănătate publică
Direcţia protecţia sănătăţii publice
Direcţia cercetare şi inovare în domeniul sănătăţii publice
Direcţia control de stat în sănătate (Inspectorat)
Direcţia analiză, planificare şi integrare a serviciilor şi resurselor în sănătate
Direcţia management date în sănătate
Direcţia tehnologia informaţiei şi comunicaţiilor
Direcţia managementul calităţii serviciilor de sănătate
Direcţia autorizare şi acreditare în sănătate
Direcţia audit intern
Direcţia financiară
Direcţia juridică
Direcţia resurse umane
Direcţia patrimoniu şi deservire utilaj medical, achiziţii
2. Centrul de sănătate publică Bălţi (mun. Bălţi, raioanele Rîşcani, Glodeni, Sîngerei şi Făleşti)
3. Centrul de sănătate publică Edineţ (raioanele Edineţ, Briceni, Ocniţa, Donduşeni)
4. Centrul de sănătate publică Soroca (raioanele Soroca, Drochia şi Floreşti)
5. Centrul de sănătate publică Ungheni (raioanele Ungheni, Călăraşi şi Nisporeni)
6. Centrul de sănătate publică Orhei (raioanele Orhei, Rezina, Teleneşti şi Şoldăneşti)
7. Centrul de sănătate publică Hînceşti (raioanele Hînceşti, Leova, Cimişlia şi Basarabeasca)
8. Centrul de sănătate publică Căuşeni (raioanele Căuşeni, Anenii Noi şi Ştefan Vodă)
9. Centrul de sănătate publică Comrat (UTA Găgăuzia)
10. Centrul de sănătate publică Cahul (raioanele Cahul, Cantemir şi Taraclia)